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24, chemin de Borde Rouge –Auzeville – CS52627
31326 Castanet Tolosan CEDEX - France

Dernière mise à jour : Mai 2018




Centre Alpin sur les Réseaux Trophiques et Ecosystèmes Lacustre

Jacquet Stéphan

Jacquet Stéphan
© S. Jacquet
Research Director

Tél. : +33 (0)4 50 26 78 12
Fax : +33 (0)4 50 26 07 60
Mail : stephan.jacquet[at]

Thématiques de recherche

Écologie microbienne aquatique (virus, bactéries, archées, (pico)phytoplancton, cyanobactéries) et réseaux trophiques pélagiques

Formation initiale et formations caractéristiques

Thèse de doctorat en Océanologie Biologique et Environnements marins

Monitorats de plongée (loisir et scientifique)

Enseignement dispensé

Plongée scientifique pour le CNRS (formation et organisation de stages)

Responsable de l’unité d’enseignements « systèmes lacustres » du MASTER2 ECOMONT (USMB)

Habilitation à diriger les recherches (HDR)


Thèses encadrées

Jade EZZEDINE : novembre 2017 – octobre 2020, Thèse de l'Université de Grenoble

Sujet : Diversité et importance des bactéries prédatrices de bactéries dans divers environnements aquatiques (C-BALO)

Xu ZHONG : Octobre 2010 - janvier 2014, Thèse de l'Université de Grenoble.
Sujet : diversité et rôle fonctionnel des virus phytoplanctoniques dans les lacs péri-alpins.
Lyria Berdjeb : Octobre 2006 - Octobre 2010. Thèse de l’Université de Savoie.
Sujet : Effet des virus et des prédateurs flagellés sur la diversité eubactérienne et la (re)distribution des ressources nutritives dans les lacs péri-alpins.
Anne Rolland : Août 2005 - Mai 2009. Thèse de l’Université de Savoie.
Sujet : Dynamique et diversité des communautés phytoplanctoniques du lac-réservoir Marne (bassin de la Seine).
Sébastien Personnic : Septembre 2003 - Octobre 2007. Thèse de l’Université de Savoie.
Sujet : Dynamique des communautés microbiennes et impacts des virus sur les bactéries auto- et hétérotrophes lacustres.

Conférences récentes données

Grandrémy N, V Frossard, J Guillard, F Arthaud, S Jacquet. 2018. Abrupt biological changes in Lake Bourget in recent years following restoration and reoligotrophication. ELLS-IAGLR Big Lakes, Small Wold Symposium, Evian-Les-Bains, France, September 2018

Jacquet, S. and F. Rimet. Restoration of the largest natural lake in France: Follow the phycoerythrin-rich phytoplankton groups! Symposium of European Freshwater Sciences, Geneva, July 2015

Jacquet, S., O. Kerimoglu, F. Rimet, G. Paolini and O. Anneville. Vie et mort d’une efflorescence cyanobactérienne, l’exemple de Planktothrix rubescens dans le lac du Bourget. Journées Internationales de Limnologie, Marseille, France, Mai 2014

Jacquet, S. Virus in aquatic environments: angels or demons? Meeting of the International Society for History, Philosophy and Social Studies of Biology (ISHPSSB), Montpellier, France, July 2013

Anneville, O., I. Domaizon and S. Jacquet. Does Climate change mitigate reoligotrophication process in lakes? Overview of the impact of temperature increase on the restoration of 3 peri-alpine lakes (Lakes Annecy, Bourget and Geneva). Constance, Germany, October 2012

Publications récentes

Leach, TH, BE Beisner, CC Carey, PM Pernica, KC Rose, Y Huot, JA Brentrup, I Domaizon, H-P Grossart, BW Ibelings, S Jacquet, PT Kelly, JA Rusak, JD Stockwell, D Straile and P. Verburg. 2018. Patterns and drivers of deep chlorophyll maxima structure in 100 lakes: the relative importance of light and thermal stratification. Limnology and Oceanography.63:628-646.

Pollet T, L Berdjeb, C Chardon and S Jacquet. 2018. Contrasting temporal patterns in ammonia oxidizing archaeal community dynamics in two neighbouring deep peri-alpine lakes. Aquatic Microbial Ecology 81:95-108

Rivera Rocabado SF, V Vasselon, S Jacquet, A Bouchez, D Ariztegui and F Rimet 2018. Metabarcoding of lake benthic diatoms: from structure assemblages to ecological assessment. Hydrobiologia 807:37-51

van de Water JAJM, L Courtial,  F Houlbrèque, S Jacquet, C Ferrier-Pagès. 2018. Ultra-violet radiation has a limited impact on seasonal differences in the Acropora muricata holobiont. Frontiers in Marine Science

Vasselon V, A Bouchez, F Rimet, S Jacquet, R Trobajo, M Corniquel, K Tapolczai and I Domaizon. 2018. Avoiding quantification bias in metabarcoding: application of a cell biovolume correction factor in diatom molecular biomonitoring. Methods in Ecology and Evolution 4:1060-1069 (IF =5.568) DOI: 10.1111/2041-210X.12960

Demory, D., L. Arsenieff, N. Simon, C. Six, F. Rigaut-Jalabert, D. Marie, P. Ge, E. Bigeard, S. Jacquet, A. Sciandra, O. Bernard, S. Rabouille and A-C. Baudoux. 2017. Temperature is a key factor involved in Micromonas - virus interactions. The ISME Journal 11:601-612

Gallina N., M. Beniston and S. Jacquet. 2017. Estimating future cyanobacterial occurrence and importance in lakes: a case study with Planktothrix rubescens in Lake Geneva. Aquatic Sciences 79:249–263

Kerimoglu, O. S. Jacquet, B. Vinçon-Leite, B. Lemaire, F. Rimet, F. Soulignac, D. Trévisan & O. Anneville. 2017. Modelling the plankton groups of the deep, peri-alpine Lake Bourget. Ecological Modeling 359:415-433

Parikka K. J., M. Le Romancer, N. Wauters and S. Jacquet. 2017. Deciphering the virus-to-prokaryote ratio: Insights into the virus-host relationships in a variety of ecosystems. Biological reviews 92:1081-1100

Activités éditoriales

Editeur d’une issue spéciale de la revue Freshwater Biology (Juin 2008) : Viruses in freshwater ecosystems

Editeur des actes du colloque (sous forme d’articles) « autour du lac du Bourget » en 2006

Reviewer, membre de l’editorial board de Frontiers in Microbiology, Microbial Ecology et Advances in Oceanography and Limnology

Membre de Commissions scientifiques

-          Musée du Léman (Nyon, Suisse) – membre du comité scientifique et président de la sous-commission « Aquarium »

-          Ecomusée de la pêche et du lac (Thonon) – membre du conseil scientifique et technique

-          Geopark Chablais UNESCO (Thonon) – membre du conseil scientifique – représentant lac

-          La maison du Lac Aqualis (Aix-les-Bains) – membre du comité scientifique

-          CISALB – responsable du suivi et membre du comité scientifique

-          Association Longitude 181 (national) – président du comité scientifique et éthique

-          Association Française de Limnologie – vice-président

Activités annexes

- Responsable scientifique du suivi environnemental du lac du Bourget depuis 2006

- Chef de rubrique « recherche » et « focus/zoom » de la revue Subaqua depuis 2010

- Co-animateur du projet d’Observatoire de Recherche en Environnement « Lacs subalpins »à ses origines

- en place des mésocosmes au Léman

- Créateur et animateur des séminaires de la SHL

- Instigateur et Organisateur du 1st European Workshop on Aquatic Phage Ecology (EWAPE-1, Thonon, France, 2-4 février 2005)

- Membre des responsables et du jury du stage de qualification au titre de chef de plongée scientifique du CNRS depuis 1998

- Membre externe de la commission de spécialistes de l’Université de Savoie pour les sections 64-68 depuis 2005

- Animateur du colloque Autour du Lac du Bourget, Mai 2006

- Créateur et Animateur du réseau français des écologistes viraux aquatiques depuis 2005

- Animateur du 22ème et 25ème stage de plongée scientifique du CNRS (Villefranche-sur-Mer, Stareso, septembre 2008 & 2011)

- Organisateur et animateur des Journées Internationales de Limnologie (Thonon-les-Bains, 2010) et membre des comités scientifiques des JILO2012, 2014 et  2016

- Co-organisateur, session leader et interviewer pour le colloque international Big lakes Small World (Evian, sept 2018)

Page web personnelle


Page web officielle

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