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IVPC External Seminar - Sebastian Lequime

19 octobre 2021

IVPC External Seminar - Sebastian Lequime
Dr Sebastian Lequime – University of Groningen – Tuesday 26th of October 2021- "Phylogeographic and phylodynamic approaches to explore viral epidemiology”

Dr Sebastian Lequime will present his work on "Phylogeographic and phylodynamic approaches to explore viral epidemiology”, Tuesday 26th of October 2021, at 1 pm, Amphitheatre G3, Université Claude Bernard Lyon 1, 50 Av Tony Garnier, 69007 Lyon.

Host: Dr Vincent Raquin

Computational analyses of pathogen genomes are increasingly being used to unravel the dispersal history and transmission dynamics of epidemics. This presentation will show how to go beyond historical reconstructions and use spatially explicit phylogeographic and phylodynamic approaches to test epidemiological hypotheses formally. As an illustration, I’ll focus on a work we have done on the West Nile virus (WNV) spread in North America. This study exploits viral genetic data to demonstrate that factors hypothesized to affect viral dispersal and demography can be statistically tested. It proves that the development and application of statistical approaches, coupled with comprehensive pathogen genomic data, can address epidemiological questions that might otherwise be difficult or unacceptably costly to answer.

Sebastian Lequime studied pharmacy at the University of Tours (France) before joining the Pasteur Institute in Paris to pursue his Ph.D. in mosquito/ virus interactions. He then joined the University of Leuven (Belgium) to work on virus evolution and its link to epidemiology/ ecology. Finally, he started his groupat the University of Groningen (The Netherlands) in 2020. He works on the dynamic of virus evolution across scales, from within-host to epidemics, using experimental and computational approaches.