Zootechnie

• Salles d’élevage

Systèmes d’élevage et/ou de stabulation d’organismes aquatiques modèles (Daphnia magna, Chironomus riparius) et spécifiques de nos systèmes aquatiques (Amphipodes, Gastéropodes, Annélides,...). Systèmes allant du litre à plusieurs centaines de litres, en condition statique ou en renouvellement continu pour des températures comprises entre 7 et 25°C.

• Bassins outdoor

1000m² de bassins situés dans une ancienne cressonnière, permettant le maintien d'une population de Gammarus fossarum dans un milieu de qualité contrôlée (partenariat avec la société Biomae)                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   

Dispositifs expérimentaux

• Expérimentation en conditions contrôlées

Dispositif pour des expositions en conditions statiques, semi-statiques et en continu pour l’ensemble des organismes étudiés par l’équipe. Ces dispositifs concernent des volumes de quelques centaines de millilitres à plusieurs litres, pour des températures de 7 à 25 °C, des niveaux de conductivité compris entre 100 et 500µS/cm et des durées pouvant aller jusqu’à plusieurs mois.

• Exposition en cours d'eau

Le laboratoire dispose de l’expertise et du matériel nécessaire pour assurer de l’encagement in situ pour plusieurs espèces, le gammare, différents gastéropodes et la larve de Chironomus riparius. Ces expositions sont réalisables sur les petits, les moyens et les grands cours d’eau et pour des durées de 1 à 6 semaines. Des essais sont également pratiqués en milieu lacustre.

• Exposition sur site industriel

Le laboratoire dispose des compétences et du matériel pour la réalisation d’expérimentations ex situ via l'installation de laboratoires de terrain, par exemple sur les rejets de stations d’épuration, permettant des expositions en continu tout en garantissant des conditions de températures et d’éclairage constantes et permettant de réaliser une gamme de dilution du rejet testé.

Analyses biologiques

• Biométrie

Le laboratoire dispose d'une salle dédiée aux mesures biométriques : loupes binoculaires et microscopes (dont un à épifluorescence), équipés de caméra permettant l’acquisition d'images, archivage et exploitation numérique de photos sur de nombreux paramètres biométriques (taille, mue, développement embryonnaire, etc….). Nous disposons également d'une ultramicrobalance (ex: réalisation de pesée individuelle sur larves ou organes isolés d'invertébrés).

• Analyses comportementales

Le laboratoire dispose de trois systèmes Toxmate de suivi du comportement locomoteur d'invertébrés, utilisable pour la mesure en continu lors d'exposition au laboratoire ou encore sur sites déportés (ex: suivi de rejets) (partenariat Viewpoint).

• Histologie

Le laboratoire est entièrement équipé pour l'histologie avec un système automatisé pour les déshydratations et les inclusions. Cette salle dispose d’un microscope équipé d’une caméra pilotée par un logiciel d’analyse d’image, pour la réalisation de nombreuses mesures biométriques sur des observations tissulaires.

• Biochimie et cytologie

Le laboratoire dispose du matériel nécessaire (microscopie à épifluorescence, logiciel d’analyse d’images, électrophorèse, ect…) pour la réalisation du test des Comètes pour la mesure de marqueur de génotoxicité (collaboration avec INRAE ENTPE).  Il dispose également d'un cytomètre en flux. Une salle est également dédiée à la mesure de biomarqueurs biochimiques via des lectures par spectrophotométrie et spectrofluorimétrie.

• Biologie moléculaire

Le labo est équipé pour la réalisation de tests in vitro du type test YES (Yeast Estrogen Screen). Il dispose du matériel nécessaire pour l'extraction et la préparation d'échantillons pour analyse ADN/ARN (Nanodrop, PCR, Séquenceur Nanopre MinION...).

• Protéomique

Le laboratoire possède un automate de préparation d'échantillons Biomek NXP, et d'un système HPLC-MSMS (QQQ 6495B AGILENT) dédié à l’analyse ciblée de biomarqueurs protéomiques (collaboration avec l'institut des sciences analytiques, Villeurbanne).